Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms