Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms