Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms