Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM41Q8WV44 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms