Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms