Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD1Q8NHV4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms