Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELBQ8NG08 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms