Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL22A1Q8NFW1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms