Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms