Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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RNF169Q8NCN4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF169Q8NCN4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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