Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC63Q8NA47 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms