Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3Q8N5Y2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms