Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC117Q8IWD4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC117Q8IWD4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms