Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME9Q86XW9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME9Q86XW9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms