Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD163Q86VB7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms