Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF554Q86TJ5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms