Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2Q1Q7Z7E8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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