Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TCF23Q7RTU1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCF23Q7RTU1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms