Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP9Q7RTR0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms