Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS2ST1Q7LGA3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms