Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms