Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMIM5Q71RC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms