Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPGS1Q6ZTW0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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