Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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