Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms