Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP12Q6UXS9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms