Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms