Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms