Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 GUK1-231ENST00000485859 325 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-237ENST00000495999 555 ntTSL 313.84□□□□□ -0.191e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 513.59□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 512.59□□□□□ -0.391e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 512.53□□□□□ -0.41e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-232ENST00000486668 738 ntTSL 312.08□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-223ENST00000478725 414 ntTSL 312.07□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 312.02□□□□□ -0.491e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-226ENST00000484953 273 ntTSL 211.82□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 311.45□□□□□ -0.581e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-219ENST00000470040 2548 ntTSL 210.89□□□□□ -0.671e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 39.64□□□□□ -0.871e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 FLNA-211ENST00000465144 398 ntTSL 214.02□□□□□ -0.174e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.889e-9■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.034e-26■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)6.91□□□□□ -1.34e-18■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.365e-6■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.754e-7■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.581e-19■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 HSP90B1-206ENST00000550479 698 ntTSL 23.89□□□□□ -1.791e-25■□□□□ 10.3
NIPBLQ6KC79 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.137e-12■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.127e-12■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.33e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 BDP1-204ENST00000508917 7194 ntTSL 1 (best)6.53□□□□□ -1.363e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 BDP1-203ENST00000508157 3403 ntTSL 54.26□□□□□ -1.733e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 H2AFZ-203ENST00000511319 1254 ntTSL 1 (best)25.5■■□□□ 1.675e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.53■■□□□ 1.525e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 H2AFZ-202ENST00000511203 1880 ntTSL 222.63■■□□□ 1.215e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 SUZ12P1-201ENST00000497969 886 ntTSL 1 (best)22.15■■□□□ 1.145e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RAD21-209ENST00000523547 908 ntTSL 319.93■□□□□ 0.785e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 EIF1-204ENST00000469308 815 ntTSL 219.42■□□□□ 0.73e-7■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.75e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.685e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 219.14■□□□□ 0.655e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 P4HB-204ENST00000466567 872 ntTSL 218.37■□□□□ 0.537e-15■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 SETD5-209ENST00000431285 1824 ntTSL 518.33■□□□□ 0.525e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 HMGXB4-203ENST00000420166 1257 ntTSL 217.14■□□□□ 0.335e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.245e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 ARF5-204ENST00000463733 1509 ntTSL 516.41■□□□□ 0.225e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-210ENST00000491236 729 ntTSL 216.41■□□□□ 0.225e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-207ENST00000553524 707 ntTSL 316.36■□□□□ 0.215e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-206ENST00000485213 947 ntTSL 216.15■□□□□ 0.185e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RSF1-208ENST00000530604 520 ntTSL 216.1■□□□□ 0.175e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 ARF5-206ENST00000489673 566 ntTSL 216.06■□□□□ 0.165e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-218ENST00000554772 562 ntTSL 315.72■□□□□ 0.115e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -05e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-214ENST00000554331 831 ntTSL 215□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-236ENST00000556783 567 ntTSL 515□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-207ENST00000488216 835 ntTSL 314.93□□□□□ -0.025e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-209ENST00000553581 572 ntTSL 414.84□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-211ENST00000491240 951 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 SF3B2-209ENST00000530322 1163 ntTSL 514.4□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-239ENST00000557239 471 ntTSL 414.24□□□□□ -0.135e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-204ENST00000466764 1375 ntTSL 313.97□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-212ENST00000553934 530 ntTSL 313.9□□□□□ -0.185e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 313.77□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)13.65□□□□□ -0.223e-7■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-208ENST00000489344 724 ntTSL 213.41□□□□□ -0.265e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-206ENST00000553413 568 ntTSL 513.39□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RAD21-202ENST00000517485 874 ntTSL 313.16□□□□□ -0.35e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-205ENST00000472897 501 ntTSL 513.06□□□□□ -0.325e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 PSMA3-AS1-212ENST00000556400 604 ntTSL 213.06□□□□□ -0.325e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 SMC6-206ENST00000446852 2460 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 HDLBP-247ENST00000498595 595 ntTSL 512.88□□□□□ -0.355e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-222ENST00000555063 573 ntTSL 212.41□□□□□ -0.425e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 HMGXB4-204ENST00000455359 1325 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 511.67□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-215ENST00000554509 563 ntTSL 411.66□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-231ENST00000556579 565 ntTSL 211.66□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 XPOT-204ENST00000540203 548 ntTSL 411.22□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.635e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-210ENST00000553769 560 ntTSL 410.89□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-217ENST00000554605 560 ntTSL 310.89□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 210.83□□□□□ -0.685e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-211ENST00000537613 894 ntTSL 210.59□□□□□ -0.715e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.745e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 510.34□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 HDLBP-235ENST00000476807 1070 ntTSL 510.3□□□□□ -0.765e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-209ENST00000490127 567 ntTSL 510.28□□□□□ -0.765e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 H2AFZ-204ENST00000511348 1843 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.85e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.85e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-223ENST00000545518 710 ntTSL 29.98□□□□□ -0.815e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-222ENST00000545388 630 ntTSL 29.88□□□□□ -0.835e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 WARS-208ENST00000553545 591 ntTSL 49.88□□□□□ -0.835e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 PSMA3-AS1-205ENST00000554378 741 ntTSL 1 (best)9.73□□□□□ -0.855e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-215ENST00000538850 1125 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.855e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 PSMA3-AS1-208ENST00000555275 903 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.865e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-213ENST00000538565 1245 ntTSL 29.6□□□□□ -0.875e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-219ENST00000541571 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.875e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-214ENST00000538709 491 ntTSL 29.52□□□□□ -0.895e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 GDI2-209ENST00000609712 622 ntTSL 39.47□□□□□ -0.895e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.95e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 ARF5-202ENST00000415666 546 ntTSL 59.39□□□□□ -0.915e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 H2AFZ-206ENST00000529158 726 ntTSL 39.39□□□□□ -0.915e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 IST1-207ENST00000534994 674 ntTSL 59.28□□□□□ -0.925e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.935e-6■□□□□ 10.2
NIPBLQ6KC79 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.965e-6■□□□□ 10.2
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 45.6 ms