Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRT80Q6KB66 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms