Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms