Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRNL1Q5VV63 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATRNL1Q5VV63 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRNL1Q5VV63 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms