Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms