Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD5Q5TGI4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms