Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP170Q5SW79 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms