Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XKR3Q5GH77 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms