Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF2Q5BJF6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms