Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3KQ59H18 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms