Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms