Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFT2D3Q587I9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFT2D3Q587I9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms