Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDCCQ504Y2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms