Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms