Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms