Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VWC2Q2TAL6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms