Protein–RNA interactions for Protein: Q16820

MEP1B, Meprin A subunit beta, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEP1BQ16820 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEP1BQ16820 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEP1BQ16820 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms