Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FXNQ16595 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FXNQ16595 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FXNQ16595 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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