Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms