Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms