Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCOA1Q15788 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
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NCOA1Q15788 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NCOA1Q15788 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NCOA1Q15788 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
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