Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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HERC1Q15751 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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HERC1Q15751 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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HERC1Q15751 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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HERC1Q15751 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERC1Q15751 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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